許仙以自己性命威嚇君寶，力保妻子和青蛇，君寶不得要領，暫且放過她們，但挾走許仙。許仙被禁錮，君寶每日向他念經，希望能助他去除魔障，許仙為早日離開，裝作茅塞頓開，愿意皈依三寶，可惜被君寶看穿意圖，仍被逼滯留在金山寺。白蛇舍不得和許仙分離，前往金山寺，向君寶苦苦哀求，請他成全和許這段姻緣，但被君寶斥退，白蛇忍無可忍，決和君寶決一死戰，青蛇不忍白蛇孤軍作戰，跟隨左右。白蛇施起法術，興波作浪，水淹金山，欲逼退君寶，救出許仙，豈料氣力不繼，一時拿捏不準，竟釀成大災難，湖水泛濫，沖倒堤壩，死傷枕藉。君寶欲用手上砵盂收伏白蛇，卻發覺收不進去，白蛇偕青蛇借水遁去。君寶命許仙前去尋找白蛇，了此孽緣，為自己贖罪，許仙以君寶冷酷無情，破口大罵，君寶帶他進城，許仙眼看黎民死傷無數，知道皆是白蛇所為，心里動搖，君寶把一道靈符交給他，要他在白蛇產子后貼在她枕下，替天行道，誅除妖孽。白蛇產下兒子，許仙尋至，心里掙扎，最后還是不忍向白蛇下毒手，但已對白蛇造成莫大傷害。青蛇揭發許仙身上藏有靈符，她大罵許仙忘恩負義，要殺許仙為白蛇吐一口氣。白蛇知許仙有心對付自己，傷心欲絕，許仙后悔莫及，跪下請罪，立誓要和白蛇生死與共。君寶知許仙未能貫徹始終，違背承諾，決親自來收伏白蛇。許仙把兒子交托大雄，自己和白蛇青蛇連夜離開。青蛇有感君寶對白蛇鍥而不舍，有心要和他同歸于盡，好讓白蛇及許仙遠走高飛，結果被君寶重創。君寶追及許仙和白蛇，窮追猛打，雙方展開連場激戰。君寶最后大獲全勝，把白蛇壓在雷峰塔下。他以白蛇所產嬰兒許仕林乃孽胎，欲斬草除根，以絕后患，但經許仙苦苦哀求，始放棄殺嬰之念，不過他要許仙答應一個條件。二十年后，他要帶許仕林回金山寺受戒，接受佛法，以防許仕林為害人間。